沪北校区图书馆面积约有4000平方米，为中庭式结构，共有四层。
一层为普通阅览室和休闲阅览室，普通阅览室共有47标准座位。休闲阅览室有28个标准座位以及休闲座位10个中间还有弧形沙发2组。二楼为书刊阅览室，有标准座位114个，休闲座位32个，单人研习室3间并且配有24个带灯书架，设计藏书2万册（以生物医学图书为主,并配有语言、小说、历史等社科类图书）。三楼为期刊合订本书库，不对读者开放。四楼为6个双人研习室和2个单人研习室供读者讨论和背诵之用。
沪北图书馆在设计之初就考虑到读者使用的舒适性，特别安装了环境控制系统，可以实时监测整个图书馆的温度、湿度、二氧化碳、已及PM2.5的指标，一旦有项目超标，就会发出报警，管理人员就会打开新风、空调等设备，让读者拥有更舒适的阅览环境。此外沪北图书馆同本部和嘉定校区图书馆一样都配有自助借还书机和自助复印机以方便读者使用图书馆。
沪西校区图书馆建于上世纪80年代，由3层阅览区域和6层书库组成，总面积约7300平方米，目前沪西图书馆的改建已经基本完成，改建后的沪西图书馆将提供多元的阅览空间和休闲空间，第一阶段将开放2层阅览空间约2800平方米，提供350个标准座位和50个休闲座位，除了3个标准阅览室之外，还有一个休闲阅览室，一个带有讲座功能的休闲空间，一个展示空间、一个自助借还书书库以及一个轻食空间，以满足学生各种需求。
为了让师生有更好的阅览体验，沪西校区图书馆融入了很多智能图书馆的功能，在所有标准阅览室设有智能空气控制系统，该系统能不间断的监控阅览室中的温度、湿度、二氧化碳、pm2.5等指标，一旦发现有指标异常就会自动打开空调、新风等设备，使读者阅读体验更舒适。此外沪西图书馆还装有电动窗帘、自助借还书机、自助复印打印机、自助办卡机等自助设备，财务处的自助投递机也将放置在图书馆以方便师生使用。
沪西校区图书馆还专门设立学科办公室满足医学院学生的专业需求，可以为师生提供情报、信息素养教育、信息咨询、查新、查收查引等服务。
沪西校区图书馆将竭诚满足师生的各种学习需求，使沪西校区图书馆成为沪西校区的文化中心。
